元佑六年（1091年） 被召还朝，任吏部尚书，未几改翰林学士承旨。同年再次遭人攻击，出知颍州（今安徽阜阳）。

元佑七年（1092年） 徙知扬州。八月，以兵部尚书召还朝。

元佑八年（1093年） 太皇太后高氏崩，哲宗亲政，新党再度得势。

苏轼继室王闰之卒于京师。

出知定州（今河北定州）。赴任前，皇帝拒绝召见，苏轼深感不安。

绍圣元年（1094年） 哲宗追述神宗新法，打击“元佑党人”。苏轼以“讥斥先朝”、“诽谤先帝”的罪名，被贬至英州（今广东英德），未至，再贬至惠州（今广东惠州）。

十月抵惠，作《惠州一绝》：“日啖荔枝三百颗，不辞长作岭南人。”

第六章 儋州岁月与北归逝世 (1095-1101)

绍圣三年（1096年） 侍妾王朝云（字子霞）在惠州病逝，苏轼深受打击。朝云是其晚年最重要的精神伴侣。

绍圣四年（1097年） 新党觉得对“元佑党人”惩罚不够，苏轼被再贬至昌化军（儋州，今海南儋州）安置。

七月抵儋，此地条件极其艰苦，“食无肉，病无药，居无室”。但苏轼仍积极办学教化，培养出海南历史上第一位举人姜唐佐。

元符三年（1100年） 哲宗崩，徽宗即位，向太后听政，诏元佑旧臣内迁。

苏轼奉命以琼州别驾的虚衔移廉州（今广西合浦），再移永州（今湖南零陵）。十一月，在北上途中接到可以自由定居的诏令。

建中靖国元年（1101年） 决定定居常州（今江苏常州）。北归途中，遍游名胜，会见友人，在金山寺见李公麟所画己像，题诗一首，中有“问汝平生功业，黄州惠州儋州”之句，成为对其一生坎坷与超越的总结。

六月，舟行至常州，因长途奔波，酷暑难当，一病不起。

七月二十八日，苏轼在常州孙氏馆（今藤花旧馆）病逝。临终前，僧友维琳在其耳畔大声说：“端明宜勿忘西方！”（端明指苏轼，因其曾任端明殿学士）苏轼微弱地回答：“西方不无，但个里着力不得。”又曰：“着力即差。”

弟苏辙遵其“即死，葬我嵩山下”的遗愿，将其与王闰之合葬于汝州郏城（今河南郏县）小峨眉山。

【后世情况】

文学影响：苏轼的诗、词、文均代表北宋最高成就，与欧阳修并称“欧苏”，为“唐宋八大家”之一；与黄庭坚并称“苏黄”；与辛弃疾并称“苏辛”；书法为“宋四家”之一。

家族后裔：子：苏迈、苏迨、苏过，皆有文才，尤以苏过（斜川居士）最为知名，常年陪伴父亲流放，人称“小坡”。

后世子孙绵延，其中一支在元明时期居于四川眉山，另一支在河南郏县守墓。